Een uitleg waar de Zuiderkerk vandaan komt en waar het nu voor wordt gebruikt.
Hendrick de Keyser, die later ook de Amsterdamse Noorderkerk en Westerkerk zou ontwerpen, ontwierp een pseudo-basiliek, bestaande uit een middenbeuk en twee lagere zijbeuken. De topgevels aan de noord- en zuidzijde zijn in de zogenaamde Amsterdamse renaissance stijl gedecoreerd, een stijl die kenmerkend is voor het werk van De Keyser.
Na zijn overlijden in 1621 werd hij bijgezet in De Zuiderkerk.
Aan de kerk is in de laatste vier eeuwen het één en ander verbouwd. Zo werden de oorspronkelijke glas-in-lood ramen aan het eind van de 17e eeuw vervangen door blank glas om de lichtinval te verbeteren.
Sinds 1929 worden er geen diensten meer gehouden en kreeg de kerk andere functies. Zo diende de kerk als opslagplaats voor bijbels en tijdens de hongerwinter van 1944-1945 deed de kerk tijdelijk dienst als mortuarium. In 1968 kwam de kerk in eigendom van de gemeente Amsterdam. De kerk werd een tijd gesloten wegens bouwvalligheid.
Een ingrijpende restauratie vond plaats tussen 1976 en 1979. Sinds 1988 is De Zuiderkerk in gebruik als gemeentelijk informatiecentrum voor ruimtelijke ordening en wonen.
In de toren van de Zuiderkerk hangt de oudste klok van Amsterdam. De klok stamt uit 1511 en komt uit de Oude Kerk. De klok wordt nog altijd geluid. Op de klok staat de volgende tekst:
"Verlosser heet ik. De bliksems beween ik. Mijn stem is de Stem des Levens. Ik roep u tot het Gewijde. Komt! In het jaar onzes Heren 1511 hebben de gebroeders Willem en Jaspar Moer mij gemaakt."
Het is mogelijk een rondleiding te krijgen in de kerk en de toren te beklimmen (toren: april t/m sept).